вначале работник должен написать заявление на перерасчет НДФЛ, потом делаете перерасчет, излишне удержанные суммы можно вернуть только! безналичным путем на банковский счет работника, либо учитывается в зарплате за последующие 3 месяца...если в течение этого срока налог не вернули, то дальше уже с процентами. Прочтите ст. 231 НК РФ, там все подробно расписано.